53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0486 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  100 
 
 		 189 aa  363  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  60.43 
 
 		 190 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  58.82 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  59.36 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  47.03 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  43.89 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  40.62 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  41.71 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  43.33 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1271  colicin V production protein  41.77 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  30.07 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  28.69 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  28.99 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  32.71 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  36.79 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  36.79 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  36.79 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  31.16 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  29.91 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  25 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  27.67 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  34.91 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  29.09 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  28.95 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  35.19 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  35.19 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  30.25 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  28.77 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  25 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  30.36 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  28.85 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  27.27 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  26.35 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  26.09 
 
 		 163 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  25.44 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  25.17 
 
 		 234 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  22.99 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  25.23 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  25.61 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  28.23 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  28.12 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  22.16 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  28.04 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  26.74 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  25.33 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  32.76 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  29.25 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  27.27 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  30.16 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  26.52 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.76 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  23.56 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  23.56 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>