30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0261 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0261  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  43.75 
 
 		 372 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  44.44 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  21.89 
 
 		 290 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 		 396 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  44.44 
 
 		 420 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  44.44 
 
 		 420 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 417 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  50 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 402 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 402 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  50 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  33.87 
 
 		 369 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 369 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 369 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  45.16 
 
 		 355 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  33.87 
 
 		 326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  33.87 
 
 		 326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 326 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  42.11 
 
 		 368 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 290 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 413 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>