15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5432 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5432  acyl carrier protein, putative  100 
 
 
83 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1686  phosphopantetheine-binding  78.31 
 
 
83 aa  130  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0229  phosphopantetheine-binding  37.04 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00664957  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3422  phosphopantetheine-binding  46.15 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3110  hypothetical protein  38.98 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44250  acyl-carrier protein  41.82 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2768  phosphopantetheine-binding  36.36 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2816  phosphopantetheine-binding protein  39.22 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02853  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3157  putative acyl carrier protein  36.67 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3444  putative acyl carrier protein  36.67 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0716  phosphopantetheine-binding  36.67 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3262  putative acyl carrier protein  36.67 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  35 
 
 
78 aa  41.2  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>