13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4354 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  100 
 
 		 236 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  50 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1160  YhhN-like protein  47.85 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0198509  normal  0.10555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  32.93 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  35.15 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  31.96 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  35.37 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  29.68 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  31.98 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  32.6 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  32.6 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  31.92 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  34.56 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>