17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2146 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  890    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  37.21 
 
 
479 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  39.88 
 
 
505 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  39.46 
 
 
512 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  35.94 
 
 
479 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  35.94 
 
 
479 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  39.18 
 
 
478 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  38.32 
 
 
480 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  34.95 
 
 
476 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  35.34 
 
 
513 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  33.76 
 
 
513 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  32.04 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  33.92 
 
 
512 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  31.89 
 
 
480 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  32.77 
 
 
503 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  30.02 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  24.65 
 
 
448 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>