14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0665 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0665  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1662  tetratricopeptide TPR_4  36.97 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.399527  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1540  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2498  hypothetical protein  35.89 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0034451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0637  tetratricopeptide TPR_4  32.78 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4769  hypothetical protein  26.32 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0994  hypothetical protein  36.97 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1986  putative transmembrane protein  35.33 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0859  Tetratricopeptide TPR_4  36.47 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3734  hypothetical protein  25.88 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0924  Tetratricopeptide TPR_4  35.88 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638112  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  34.83 
 
 		 619 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  39 
 
 		 620 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>