18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1071 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1860  hypothetical protein  61.67 
 
 
821 aa  991    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.441776  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3293  hypothetical protein  91.55 
 
 
776 aa  1419    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.642367  normal  0.855999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1071  protein of unknown function DUF324  100 
 
 
778 aa  1600    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2527  hypothetical protein  22.55 
 
 
791 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1917  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  29 
 
 
526 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1835  hypothetical protein  20.71 
 
 
738 aa  78.2  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1008  hypothetical protein  24.26 
 
 
808 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1440  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  25.06 
 
 
402 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0982  hypothetical protein  24.15 
 
 
408 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0137  protein of unknown function DUF324  18.82 
 
 
757 aa  59.3  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2053  hypothetical protein  23.85 
 
 
415 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2386  Csx10 family CRISPR-associated RAMP protein  23.36 
 
 
426 aa  53.5  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20510  RAMP superfamily protein  25 
 
 
186 aa  52  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  27.54 
 
 
237 aa  51.6  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1803  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  24.71 
 
 
423 aa  50.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3211  hypothetical protein  19.79 
 
 
533 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1377  hypothetical protein  31.5 
 
 
819 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>