26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8121 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  31.35 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  45.56 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  34.36 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  36.02 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  32.78 
 
 
225 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1615  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8040  hypothetical protein  30.29 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  30.11 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  29.67 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  26.76 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  30.16 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  31.74 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  30.08 
 
 
197 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  39.13 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  26.99 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2429  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  26.81 
 
 
237 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  26.62 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  24.44 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4541  protein of unknown function DUF820  29.69 
 
 
208 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2334  hypothetical protein  30.43 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1492  hypothetical protein  25.87 
 
 
208 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  26.02 
 
 
186 aa  40.8  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>