15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8099 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  100 
 
 
119 aa  229  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  38.46 
 
 
184 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  35.48 
 
 
197 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  39.36 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  31.43 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  32.93 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  38.61 
 
 
201 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  34.41 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  36.56 
 
 
184 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  35.48 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  31.11 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  36.26 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  23.57 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  31.73 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  26.06 
 
 
191 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>