21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7983 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  100 
 
 
530 aa  1003    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  32.12 
 
 
492 aa  96.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  32.14 
 
 
529 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  39.39 
 
 
422 aa  84  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  32.4 
 
 
595 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1245  hypothetical protein  27.78 
 
 
553 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537761  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0656  hypothetical protein  31.94 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  29.81 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3585  hypothetical protein  32.49 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  29.4 
 
 
787 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  45.56 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  27.98 
 
 
437 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  32.94 
 
 
421 aa  64.7  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  39.38 
 
 
495 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04460  hypothetical protein  31.01 
 
 
432 aa  54.7  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  36.55 
 
 
410 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  34.21 
 
 
621 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1269  hypothetical protein  29.23 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0914584  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2535  PE-PGRS family protein  44.62 
 
 
419 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  36.25 
 
 
3409 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24130  hypothetical protein  29.41 
 
 
487 aa  43.5  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>