12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5207 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5207  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284913  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0869  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.21 
 
 		 651 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456252  normal  0.192635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4226  RNA polymerase sigma factor containing a TPR repeat domain-like protein  40 
 
 		 680 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4561  hypothetical protein  36.84 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0028561  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19640  site-specific recombinase XerD  31.84 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0211169  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7182  hypothetical protein  35.03 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.0722414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4666  hypothetical protein  54.17 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 303 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 303 aa  45.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 303 aa  45.4  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  33.91 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>