25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2552 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  200  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  73 
 
 		 100 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  69.23 
 
 		 96 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  67.39 
 
 		 95 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  69.88 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  62.37 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  61.05 
 
 		 97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  59.78 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  67.9 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  64.58 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  64.13 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  67.69 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  57.14 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  39.77 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  39.66 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1797  protein of unknown function UPF0153  31.33 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.370926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  32.61 
 
 		 361 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  35.14 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  33.78 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  36.25 
 
 		 198 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2747  hypothetical protein  43.48 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71102  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  32.43 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  30.12 
 
 		 220 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>