13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2027 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0386  hypothetical protein  67.86 
 
 		 457 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2243  hypothetical protein  57.14 
 
 		 458 aa  59.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129257  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1867  hypothetical protein  50 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1702  hypothetical protein  52.63 
 
 		 448 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2049  hypothetical protein  50 
 
 		 453 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1580  hypothetical protein  47.62 
 
 		 427 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.482239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0619  uncharacterized membrane-anchored protein  36.96 
 
 		 435 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3284  hypothetical protein  35.71 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28343  normal  0.450166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1646  hypothetical protein  38 
 
 		 442 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.669272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0238  hypothetical protein  40.48 
 
 		 427 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1881  hypothetical protein  40.48 
 
 		 427 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0712  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>