14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2827 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2827  HD domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2513  HD domain-containing protein  96.04 
 
 		 202 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1673  HD domain-containing protein  35.75 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1650  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 243 aa  95.5  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0335969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2544  metal dependent phophohydrolase  31.03 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05390  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.9 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.59281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3081  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 479 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2470  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0901  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  47.37 
 
 		 477 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0699  polynucleotide adenylyltransferase region  23.78 
 
 		 463 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0344  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 228 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 458 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>