20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1126 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1126  feoA family protein  100 
 
 		 73 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00055318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0971  ferrous iron repressor  95.89 
 
 		 73 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206461  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1460  FeoA family protein  39.44 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0251993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0971  FeoA family protein  36.23 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0265953 
 
 
-
 
NC_002936  DET0096  feoA family protein  37.5 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0639757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1451  hypothetical protein  32.86 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.460876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1139  FeoA family protein  34.72 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000849917  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0778  hypothetical protein  26.76 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1434  hypothetical protein  37.18 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000297198  normal  0.0224554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6020  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.25592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2565  FeoA family protein  27.94 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.595297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0467  FeoA family protein  31.43 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0108  FeoA family protein  32.86 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000928646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0542  FeoA family protein  35.71 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000870472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1090  FeoA family protein  31.88 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000287445  hitchhiker  0.0000000000000312699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1952  FeoA family protein  28.38 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000344401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.21 
 
 		 221 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  46.15 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0975  FeoA family protein  29.73 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00201528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>