20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0971 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0971  ferrous iron repressor  100 
 
 
73 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1126  feoA family protein  95.89 
 
 
73 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00055318  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1451  hypothetical protein  32.86 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.460876  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1460  FeoA family protein  39.44 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0251993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0971  FeoA family protein  33.8 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0265953 
 
 
-
 
NC_002936  DET0096  feoA family protein  36.11 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0639757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1434  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000297198  normal  0.0224554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2565  FeoA family protein  27.94 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.595297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0634  FeoA family protein  30.67 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000754558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1139  FeoA family protein  34.72 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000849917  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0778  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6020  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.25592  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0467  FeoA family protein  31.43 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0542  FeoA family protein  35.71 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000870472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.71 
 
 
221 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1090  FeoA family protein  31.88 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000287445  hitchhiker  0.0000000000000312699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0849  FeoA family protein  30 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  46.15 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0108  FeoA family protein  30 
 
 
78 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000928646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>