15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0220 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0220  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 61 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.297456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0221  iron-sulfur cluster-binding protein  98.36 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0444  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0435  BFD-like iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  46.15 
 
 		 1188 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1808  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.540024  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0978  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.3 
 
 		 484 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2866  2Fe-2S-binding domain-containing protein  45 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0554434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2551  2Fe-2S-binding domain-containing protein  45 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 1228 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  38.46 
 
 		 1180 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1266  assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  38.98 
 
 		 537 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.579609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1669  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  67.65 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.856867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  42.31 
 
 		 901 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1179  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>