23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04540 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01558  Myosin-1 (Class I unconventional myosin)(Type I myosin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00647]  57.85 
 
 
1249 aa  1275    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.294157  normal  0.0868257 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04540  microfilament motor, putative  100 
 
 
1274 aa  2629    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79258  Myosin-5 isoform  50.9 
 
 
1256 aa  1133    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40911  predicted protein  38.65 
 
 
1453 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844333  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75361  Myosin-2 (Class V unconventional myosin MYO2) (Type V myosin heavy chain MYO2) (Myosin V MYO2)  36.1 
 
 
1571 aa  430  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120834 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08862  Aspergillus nidulans myosin V homolog (Eurofung)  34.37 
 
 
1569 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06470  nonmuscle myosin heavy chain b, putative  34.46 
 
 
1625 aa  406  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347127  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_292  predicted protein  35.77 
 
 
763 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04706  myosin II homolog (Eurofung)  36.08 
 
 
2404 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66079  Myosin-1 (Type II myosin)  33.99 
 
 
1874 aa  389  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.549994 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54688  predicted protein  34.04 
 
 
1027 aa  360  9e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_432  predicted protein  33.38 
 
 
867 aa  358  5e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05780  MYO2-related  31.76 
 
 
1576 aa  344  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16379  predicted protein  34.39 
 
 
769 aa  329  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191953  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_52058  predicted protein  32.33 
 
 
867 aa  328  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51848  predicted protein  31.26 
 
 
932 aa  308  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25867  predicted protein  29.39 
 
 
804 aa  266  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  27.35 
 
 
1895 aa  177  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  22.31 
 
 
1852 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10999  actin polymerization protein Bzz1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01200)  31.85 
 
 
482 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.551222  normal  0.946602 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02130  cell division control protein Cdc25, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16240)  35.82 
 
 
1241 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2711  hypothetical protein  29.79 
 
 
385 aa  46.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.599559  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67177  predicted protein  34.95 
 
 
438 aa  45.8  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>