16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01990 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ01990  nucleolar essential protein 1, putative  100 
 
 		 334 aa  688    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55133  predicted protein  67.3 
 
 		 250 aa  350  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0189665  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02759  RNA processing protein Emg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06010)  63.14 
 
 		 260 aa  326  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.458215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39810  predicted protein  45.87 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.368845  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11653  predicted protein  46.51 
 
 		 174 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432988  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0557  ribosome biogenesis protein  29.69 
 
 		 232 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0625  ribosome biogenesis protein  29.45 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0188  ribosome biogenesis protein  29.47 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0915  Suppressor Mra1 family protein  29.12 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13379  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0820  ribosome biogenesis protein  35.65 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0045  Suppressor Mra1 family protein  36.45 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1590  ribosome biogenesis protein  32.76 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1803  ribosome biogenesis protein  34.19 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.022092  normal  0.296556 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2054  ribosome biogenesis protein  33.62 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.532085 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0747  ribosome biogenesis protein  34.88 
 
 		 209 aa  50.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0675798  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1625  ribosome biogenesis protein  24.35 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>