15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00900 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF00900  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1245    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06492  HapE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P87092]  61.9 
 
 
265 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.201709  hitchhiker  0.00000000339428 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50486  CCAAT- binding transcription factor component  58.04 
 
 
116 aa  143  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.75707  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7962  predicted protein  61.76 
 
 
105 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00736211  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_7801  predicted protein  55.17 
 
 
87 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03660  DNA polymerase epsilon p12 subunit (dna polymerase epsilon subunit 4), putative  37.66 
 
 
317 aa  65.1  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421704  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46740  predicted protein  42.67 
 
 
338 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10809  putative CCAAT-box-binding transcription factor (Eurofung)  35.06 
 
 
251 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.846198 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30658  DNA-directed DNA polymerase epsilon, subunit C  30.07 
 
 
284 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35532  normal  0.692022 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34929  predicted protein  43.75 
 
 
98 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0549515 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86136  predicted protein  35.44 
 
 
158 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186044  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47041  predicted protein  31.82 
 
 
206 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645453  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10523  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 
339 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19031  predicted protein  32.89 
 
 
205 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227098  normal  0.0123059 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43730  predicted protein  33.33 
 
 
229 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>