18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01010 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01010  importin beta-2 subunit, putative  100 
 
 		 924 aa  1901    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00926  KapC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2LD07]  36.33 
 
 		 939 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335104  normal  0.533348 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80310  predicted protein  35.36 
 
 		 938 aa  550  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29487  predicted protein  33.86 
 
 		 910 aa  511  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.505299  decreased coverage  0.00488082 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46132  predicted protein  32.43 
 
 		 1007 aa  369  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00906  Putative karyopherin/importin beta-1Putative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z9L0]  24.6 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00266285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36086  predicted protein  21.83 
 
 		 873 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.32944  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05717  importin beta-3 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06790)  22.12 
 
 		 1095 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23582  predicted protein  24.78 
 
 		 764 aa  54.7  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88418  karyopherin-beta  23.26 
 
 		 870 aa  53.9  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01160  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 865 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69854  Karyopherin Functions in nuclear transport of proteins  22.56 
 
 		 1090 aa  52  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25726  predicted protein  27.27 
 
 		 1015 aa  51.6  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779434  decreased coverage  0.000347416 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00890  importin beta-4 subunit, putative  30.77 
 
 		 1080 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  20.91 
 
 		 2611 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41924  predicted protein  23.26 
 
 		 979 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.123239  normal  0.112463 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36650  predicted protein  23.26 
 
 		 979 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0159374  normal  0.125741 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02120  importin subunit beta-4, putative (JCVI)  23.25 
 
 		 1093 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>