19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00720 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE00720  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 955 aa  1970    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3348  formyl transferase-like protein  29.64 
 
 		 588 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2809  putative sensor protein  31.44 
 
 		 591 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1957  formyl transferase domain-containing protein  30.75 
 
 		 602 aa  240  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0525  hydrogenase regulation HoxX  29.26 
 
 		 565 aa  235  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2013  formyl transferase domain-containing protein  29.81 
 
 		 575 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1425  NiFe-hydrogenase maturation factor, HypX/HoxX type  27.98 
 
 		 546 aa  228  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4101  formyl transferase-like  29.07 
 
 		 565 aa  222  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  29.32 
 
 		 564 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3963  formyl transferase  26.99 
 
 		 558 aa  195  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1541  formyl transferase-like protein  28.57 
 
 		 579 aa  194  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00137712  normal  0.223229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 572 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2450  formyl transferase domain-containing protein  29.71 
 
 		 590 aa  162  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1209  formyl transferase domain-containing protein  23.79 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.111228 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  25.9 
 
 		 254 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.7 
 
 		 261 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2750  enoyl-CoA hydratase  28.97 
 
 		 254 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 		 264 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>