13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05940 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND05940  capsular associated protein  100 
 
 		 641 aa  1326    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203249  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02810  CAP1-related  42.73 
 
 		 636 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04750  cryptococcal xylosyltransferase 1  36.35 
 
 		 694 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442264  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02330  conserved hypothetical protein  48.74 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723576  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04030  CAP1-related  29.21 
 
 		 771 aa  220  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01140  capsular associated protein  29.11 
 
 		 640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04084  capsule-associated protein CAP1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05595)  27.27 
 
 		 585 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.887387  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00246  capsular associated protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05300)  30.56 
 
 		 874 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.323028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  25.89 
 
 		 597 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  23.86 
 
 		 559 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  22.91 
 
 		 381 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  36.59 
 
 		 519 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  26.5 
 
 		 562 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>