17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04000 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC04000  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 455 aa  931    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05630  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11040)  29.45 
 
 		 707 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.246527 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57570  predicted protein  25.19 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0322438  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  26.2 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  25.19 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  25.14 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27063  predicted protein  25.13 
 
 		 813 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00530914  hitchhiker  0.0000354859 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38974  predicted protein  28.8 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103286  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14780  predicted protein  24.47 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.116373 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34722  predicted protein  31.3 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0720158  normal  0.0311419 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18374  predicted protein  28.7 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.892854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16466  predicted protein  29.1 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89730  predicted protein  23.29 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00881684 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32467  predicted protein  32.94 
 
 		 609 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215705  normal  0.136485 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15488  predicted protein  28.88 
 
 		 490 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427459  decreased coverage  0.000333218 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49481  predicted protein  27.14 
 
 		 1068 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25650  predicted protein  26.15 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>