12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07980 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA07980  60s ribosomal protein l34-b, putative  100 
 
 		 113 aa  228  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69102  ribosomal protein L34  71.43 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04522  ribosomal protein L34 protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03040)  64.6 
 
 		 116 aa  146  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.154238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44291  predicted protein  47.47 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37383  Ribosomal protein L34, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.11 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00325631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1500  50S ribosomal protein L34e  39.74 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1650  50S ribosomal protein L34e  37.18 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473141  normal  0.970991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0264  50S ribosomal protein L34e  37.18 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0978  50S ribosomal protein L34e  35.9 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1128  50S ribosomal protein L34e  36.05 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.268556  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0627  ribosomal protein L34e  32.94 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1752  Ribosomal protein L34e  35.62 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>