18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0030 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  234  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  98.23 
 
 
113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  74.07 
 
 
111 aa  163  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  43.4 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  36.45 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  38.64 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  39.77 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.4 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.19 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.4 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  39.56 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  36.61 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  33 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  40.38 
 
 
121 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  33.68 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  26.67 
 
 
218 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>