17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tPseudo01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tPseudo01  tRNA-OTHER  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0017  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>