14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1825 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1825  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.713592  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  34.75 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  35.09 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  36.96 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  34.38 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  35.34 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  31.3 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  38.27 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  31.45 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  33.78 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 		 119 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  24.11 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>