23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1503 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1503  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
104 aa  203  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0241  FolB domain-containing protein  50.96 
 
 
105 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1694  dihydroneopterin aldolase  40.38 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000000764961  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0981  dihydroneopterin aldolase  40.82 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0043916  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0665  dihydroneopterin aldolase  43.14 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0236  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0380  FolB domain-containing protein  43.16 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0405  FolB domain-containing protein  42.11 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.791342  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0176  dihydroneopterin aldolase  37.76 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1602  FolB domain-containing protein  42.11 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  23.81 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  22.61 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  27.19 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  26.05 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
117 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  26.05 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  28.07 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  25.23 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4023  dihydroneopterin aldolase  26.89 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  27.19 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  27.19 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>