15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0241 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0241  FolB domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  209  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1503  dihydroneopterin aldolase  50.96 
 
 
104 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0981  dihydroneopterin aldolase  40.38 
 
 
108 aa  86.7  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0043916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1694  dihydroneopterin aldolase  44.23 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000000764961  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0405  FolB domain-containing protein  44.33 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.791342  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0176  dihydroneopterin aldolase  36.73 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0380  FolB domain-containing protein  44.33 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1602  FolB domain-containing protein  43.3 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0236  dihydroneopterin aldolase  31.96 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0665  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  23.89 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>