16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1715 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1715  TM2  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.67624  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1791  TM2  54.24 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0956269  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0744  TM2  50.44 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1809  TM2  45.69 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2084  TM2 domain containing protein  47.14 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  43.06 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1700  TM2 domain-containing protein  35 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0217305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  40.96 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  27.27 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  27.27 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  46.77 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 169 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>