18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0213 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0213  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  503  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2241  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0042  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  46.15 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0191  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  41.9 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0064  hypothetical protein  43.6 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2267  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.9 
 
 		 344 aa  187  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.83 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  27.34 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.37 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  28.07 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.56 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.56 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  30.28 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  32.23 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  29.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.25 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  26.96 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  35.09 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>