21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1623 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1623  nodulation efficiency protein D (NfeD)  100 
 
 
132 aa  261  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0799606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1526  nodulation efficiency protein D (NfeD)  49.62 
 
 
130 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1030  nodulation efficiency protein D (NfeD)  37.88 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.576524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  31.15 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  27.69 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.33 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  25.89 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  28.91 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  26.45 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  24.62 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>