18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0348 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1846  DotA protein  99.38 
 
 
806 aa  1640    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0348  DotA  100 
 
 
814 aa  1663    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2827  putative TraY/DotA-like type IV secretion system protein  23.39 
 
 
751 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0988  hypothetical protein  23.05 
 
 
770 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2613  defect in organelle trafficking protein DotA  31.45 
 
 
1047 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2740  defect in organelle trafficking protein DotA  29.06 
 
 
1035 aa  129  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3946  hypothetical protein  22.69 
 
 
972 aa  104  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1097  hypothetical protein  26.21 
 
 
842 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.361233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5350  hypothetical protein  30.99 
 
 
960 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2064  integral membrane protein  22.06 
 
 
653 aa  87.8  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0863025  normal  0.971709 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5612  hypothetical protein  21.71 
 
 
752 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.167609 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0064  traY protein  21.11 
 
 
714 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3854  hypothetical protein  22.14 
 
 
776 aa  68.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0097  type IV secretion system protein DotA-like protein  24.68 
 
 
840 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1685  hypothetical protein  24.02 
 
 
665 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.155635  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0069  traY protein  24.68 
 
 
714 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4275  hypothetical protein  26.03 
 
 
880 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0084  integral membrane protein  25.98 
 
 
722 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.421711  normal  0.537014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>