50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08801 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  73.16 
 
 
487 aa  731    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  100 
 
 
487 aa  996    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  60.38 
 
 
510 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  58 
 
 
499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  59.88 
 
 
497 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  60.29 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  57.97 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  54.53 
 
 
505 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.82 
 
 
502 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.61 
 
 
486 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.05 
 
 
475 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  45.49 
 
 
473 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  42.44 
 
 
475 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  51.62 
 
 
473 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50 
 
 
464 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  49.33 
 
 
471 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  47.77 
 
 
462 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.85 
 
 
465 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  46.28 
 
 
473 aa  350  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  48.34 
 
 
475 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.99 
 
 
469 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  47.16 
 
 
511 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.31 
 
 
463 aa  338  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  45.05 
 
 
469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.48 
 
 
461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  49.6 
 
 
476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  46.74 
 
 
461 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  46.74 
 
 
461 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  46.74 
 
 
461 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  45.74 
 
 
503 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  44.97 
 
 
463 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  47.46 
 
 
480 aa  333  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  39.79 
 
 
460 aa  332  9e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  43.47 
 
 
463 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  41.35 
 
 
478 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  48.23 
 
 
464 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.34 
 
 
507 aa  319  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  46.4 
 
 
459 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  39.41 
 
 
477 aa  315  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  26.47 
 
 
304 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  23.02 
 
 
307 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  24.62 
 
 
334 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.05 
 
 
678 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  24.26 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  25.2 
 
 
306 aa  47  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  24.04 
 
 
334 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  24.04 
 
 
334 aa  47  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.89 
 
 
664 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  23.4 
 
 
334 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  27.27 
 
 
711 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>