13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08671 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08671  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2471  hypothetical protein  30.5 
 
 
195 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1658  hypothetical protein  37.8 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.105631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1164  hypothetical protein  36.3 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2373  hypothetical protein  31.08 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 
416 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2324  Calcium-binding EF-hand-containing protein  33.17 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 
417 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2835  hypothetical protein  33.17 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105158  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1429  hypothetical protein  34.96 
 
 
273 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1832  hypothetical protein  25.43 
 
 
285 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0910711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0303  hypothetical protein  25.56 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0499  hypothetical protein  19.47 
 
 
445 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>