14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01835 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01835  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  712    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0670958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  33.33 
 
 
580 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  31.71 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  35.29 
 
 
452 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  30.95 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  24.42 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  24.19 
 
 
456 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1451  hypothetical protein  30.59 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  30 
 
 
486 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  30.12 
 
 
450 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  24.66 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  22.41 
 
 
349 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  30.59 
 
 
414 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  22.29 
 
 
367 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>