19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01235 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  802    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  25.2 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  25.33 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 698 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  23.53 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  23.86 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  24.39 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  23.16 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  21.63 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  22.14 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  20.53 
 
 		 474 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  22.87 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  20.61 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1847  putative neutral invertase-like protein  19.95 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.570169  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0487  putative neutral invertase-like protein  20.46 
 
 		 485 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.782741  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  20.42 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.87 
 
 		 746 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  19.9 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  21.15 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>