25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0824 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0824  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794213  normal  0.445221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0543  hypothetical protein  63.27 
 
 		 98 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5175  cupin 2 domain-containing protein  62.24 
 
 		 98 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3262  cupin 2, barrel  61.22 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5106  cupin 2 domain-containing protein  61.22 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2546  cupin 2 domain-containing protein  55.1 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.98 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.04 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2346  cupin 2 domain-containing protein  38.04 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  24.21 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  24.51 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.69 
 
 		 121 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  24.47 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  25.47 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  25.47 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  25.47 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  22.92 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  25.71 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  25.71 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  22.92 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  22.92 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  22.92 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>