22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0625 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0625  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  100 
 
 
270 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4297  2OG-Fe(II) oxygenase  93.7 
 
 
270 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.368434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3873  2OG-Fe(II) oxygenase  79.79 
 
 
289 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0524705  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3395  2OG-Fe(II) oxygenase  75.63 
 
 
269 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4242  2OG-Fe(II) oxygenase  75.63 
 
 
269 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4124  2OG-Fe(II) oxygenase  75.63 
 
 
269 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1911  2OG-Fe(II) oxygenase  75.21 
 
 
268 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4468  2OG-Fe(II) oxygenase  75.63 
 
 
269 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1804  2OG-Fe(II) oxygenase  69.47 
 
 
267 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130768 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0755  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 
396 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1905  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75.44 
 
 
257 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1048  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 
397 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0783  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 
256 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0694  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 
256 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467875  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2023  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 
397 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676178  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4019  2OG-Fe(II) oxygenase  74.37 
 
 
269 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  0.70334 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2069  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 
283 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1765  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 
397 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3538  2OG-Fe(II) oxygenase  74.37 
 
 
269 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  25.44 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  22.44 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  23.73 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>