22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2174 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2174  transmembrane protein  100 
 
 
225 aa  433  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2094  conserved transmembrane protein  86.22 
 
 
226 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0089  hypothetical protein  75.45 
 
 
225 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.081156  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5905  hypothetical protein  70.42 
 
 
221 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2622  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1963  hypothetical protein  71.29 
 
 
221 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2574  hypothetical protein  71.29 
 
 
221 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2598  hypothetical protein  71.29 
 
 
221 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0756  hypothetical protein  64.29 
 
 
219 aa  258  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144399  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2493  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.998378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0723  hypothetical protein  67.92 
 
 
225 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7221  hypothetical protein  42.05 
 
 
199 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1020  hypothetical protein  37.44 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.37406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2983  hypothetical protein  35.68 
 
 
210 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000560028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5040  hypothetical protein  36.97 
 
 
221 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0337  hypothetical protein  40.58 
 
 
211 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4188  hypothetical protein  36.23 
 
 
203 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2870  hypothetical protein  33.64 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.922239  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1370  hypothetical protein  35.87 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.73391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0084  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6316  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1418  Gram-positive anchor  27.78 
 
 
262 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>