17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4932 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  100 
 
 
625 aa  1285    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07240  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  37.56 
 
 
269 aa  144  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  34.27 
 
 
296 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  29.15 
 
 
274 aa  94  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1094  GumL  30 
 
 
274 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  33.82 
 
 
264 aa  88.6  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4937  hypothetical protein  26.42 
 
 
696 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2755  exoV domain-containing protein  29.84 
 
 
271 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  28.95 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1102  hypothetical protein  37.66 
 
 
240 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.804004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2361  exoV domain-containing protein  25.99 
 
 
266 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07265  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  27.85 
 
 
277 aa  55.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47160  predicted protein  25.76 
 
 
390 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000445115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2966  ExoV-like protein  24.3 
 
 
296 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0575869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6706  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
492 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671314  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  28.77 
 
 
333 aa  44.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3832  succinoglycan biosynthesis ketolase  24.66 
 
 
304 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>