20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0730 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  227  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  73.87 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  88.12 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  68.7 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  66.39 
 
 		 123 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  62.28 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  71.3 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  71.56 
 
 		 113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  69.91 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  69.91 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  67.96 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  61.54 
 
 		 109 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  74.51 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  68.42 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  70.27 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  49.54 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  27 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  30.23 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.967687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>