19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5568 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5568  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1858  hypothetical protein  50.81 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1142  hypothetical protein  50.94 
 
 
106 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71833  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0455  hypothetical protein  47.17 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0159  hypothetical protein  46 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1021  hypothetical protein  46 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1328  hypothetical protein  46 
 
 
99 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2754  hypothetical protein  46 
 
 
99 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2612  hypothetical protein  46 
 
 
99 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0185  hypothetical protein  44.79 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6000  hypothetical protein  42.06 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4013  hypothetical protein  40.19 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4354  hypothetical protein  40.19 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1666  hypothetical protein  47.66 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0340303  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3763  hypothetical protein  47.37 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4237  hypothetical protein  48 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257801  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4090  cold-shock DNA-binding protein family protein  27.64 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.25862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4848  cold-shock DNA-binding domain protein  30.95 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00619999  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0821  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.42 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>