20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3185 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  201  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0257784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  57 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  43.53 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  43.53 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2559  hypothetical protein  43.53 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5866  hypothetical protein  43.84 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665282  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0947  hypothetical protein  42.25 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.593029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2134  hypothetical protein  42.25 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0943  hypothetical protein  42.25 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1096  hypothetical protein  41.1 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  41.27 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  41.27 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0760  hypothetical protein  39.73 
 
 
103 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668684  normal  0.055839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  37.84 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  35.63 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  40.79 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  40.79 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4214  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0502  hypothetical protein  31.37 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0291324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>