55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0571 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0571  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.00795396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4145  hypothetical protein  93.05 
 
 
187 aa  358  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0302  hypothetical protein  71.12 
 
 
199 aa  291  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6144  hypothetical protein  61.58 
 
 
189 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0487  hypothetical protein  58.95 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3136  hypothetical protein  58.73 
 
 
189 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2814  hypothetical protein  60.53 
 
 
189 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2825  hypothetical protein  60.53 
 
 
189 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2200  hypothetical protein  60.53 
 
 
189 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.185923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0732  hypothetical protein  58.2 
 
 
189 aa  228  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1482  hypothetical protein  60 
 
 
181 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2911  hypothetical protein  60 
 
 
181 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0106  hypothetical protein  60 
 
 
181 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0457  hypothetical protein  57.67 
 
 
189 aa  225  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0565  hypothetical protein  59.44 
 
 
181 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0549  hypothetical protein  58.89 
 
 
181 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2732  hypothetical protein  61.05 
 
 
189 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2874  hypothetical protein  61.05 
 
 
189 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0346  hypothetical protein  57.58 
 
 
188 aa  201  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22064  hitchhiker  0.000122714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4028  signal peptide protein  36.65 
 
 
208 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4180  putative signal peptide protein  41.61 
 
 
187 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0328239  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4292  signal peptide protein  41.61 
 
 
187 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03145  signal peptide protein  41.56 
 
 
187 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.561242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0203  putative signal peptide protein  38.04 
 
 
226 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0993  hypothetical protein  33.15 
 
 
177 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262375  normal  0.178793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0849  hypothetical protein  33.15 
 
 
177 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3809  hypothetical protein  34.57 
 
 
236 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0504  hypothetical protein  36.59 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0953  hypothetical protein  30.56 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01920  lipidA 3-O-deacylase  30.94 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5424  hypothetical protein  28.47 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5310  Lipid A 3-O-deacylase  29.3 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0737  hypothetical protein  32.86 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0765  hypothetical protein  32.86 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61650  Lipid A 3-O-deacylase  28.66 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0713933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0023  hypothetical protein  38.3 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5636  hypothetical protein  29.08 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0778  hypothetical protein  32.14 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1324  hypothetical protein  27.59 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.232671  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4452  hypothetical protein  31.08 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1064  hypothetical protein  28.33 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0010  hypothetical protein  35.78 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0022  hypothetical protein  36.84 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0024  hypothetical protein  36 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0942  hypothetical protein  27.74 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0424238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0006  hypothetical protein  36 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2560  hypothetical protein  30.67 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3154  hypothetical protein  29.33 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0288324  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4744  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179642  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1159  hypothetical protein  40 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2892  hypothetical protein  28.03 
 
 
173 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2700  hypothetical protein  26.11 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3668  hypothetical protein  28.97 
 
 
180 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000166039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00035  hypothetical protein  28.12 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0161  hypothetical protein  31.46 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>