38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6450 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6450  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  38.92 
 
 		 473 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  64.06 
 
 		 498 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  62.5 
 
 		 470 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  50 
 
 		 470 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  59.38 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  32.52 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  54.1 
 
 		 466 aa  71.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  56.45 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  55.36 
 
 		 471 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  60 
 
 		 462 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  52.54 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  45.71 
 
 		 471 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  48.39 
 
 		 510 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  50 
 
 		 465 aa  61.6  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  45.45 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  46.38 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  54.1 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  43.48 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  43.48 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  42.17 
 
 		 503 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  50 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  51.92 
 
 		 464 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  46.67 
 
 		 468 aa  55.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  48.98 
 
 		 487 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  51.02 
 
 		 493 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  44.83 
 
 		 476 aa  51.6  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  48 
 
 		 474 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  32.81 
 
 		 458 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  46 
 
 		 479 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  39.58 
 
 		 477 aa  48.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  51.02 
 
 		 494 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  51.02 
 
 		 494 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  46.94 
 
 		 495 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  41.67 
 
 		 437 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  44.74 
 
 		 465 aa  41.2  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>