18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3854 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3854  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1565    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2827  putative TraY/DotA-like type IV secretion system protein  24.14 
 
 		 751 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0988  hypothetical protein  24 
 
 		 770 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3946  hypothetical protein  23.03 
 
 		 972 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2064  integral membrane protein  23.03 
 
 		 653 aa  111  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0863025  normal  0.971709 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0084  integral membrane protein  21.22 
 
 		 722 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.421711  normal  0.537014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5350  hypothetical protein  24.5 
 
 		 960 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0069  traY protein  22.45 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1097  hypothetical protein  23.98 
 
 		 842 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.361233  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0097  type IV secretion system protein DotA-like protein  23.3 
 
 		 840 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551932  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0064  traY protein  22.18 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0348  DotA  25.11 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1846  DotA protein  24.08 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5612  hypothetical protein  21.85 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.167609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1685  hypothetical protein  35.9 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.155635  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4275  hypothetical protein  28.83 
 
 		 880 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2613  defect in organelle trafficking protein DotA  25.22 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2740  defect in organelle trafficking protein DotA  25.22 
 
 		 1035 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>