10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2660 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2660    100 
 
 		 404 bp  801    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293823  normal  0.612085 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8190    95.35 
 
 		 533 bp  69.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.531231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2772  hypothetical protein  94.59 
 
 		 321 bp  58  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407884  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  90.7 
 
 		 396 bp  54  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  90.7 
 
 		 351 bp  54  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3761    84 
 
 		 759 bp  54  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3261  hypothetical protein  92.11 
 
 		 309 bp  52  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.510303  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0109    90.48 
 
 		 383 bp  52  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1565  hypothetical protein  91.89 
 
 		 282 bp  50.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3954    87.23 
 
 		 754 bp  46.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>