14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1707 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1707  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  191  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  31.87 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  31.87 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  31.52 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  30.11 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  29.55 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  26.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  32.1 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  30.12 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0572  hypothetical protein  30.53 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.172357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  34.55 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  23.66 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  28.95 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>